Фильм основан на фантастическом анимационном сериале Ханны и Барберы, выходившем в середине 1960-х годов «Джонни Квест».
Кот Томас и мышонок Джерри отдыхают на побережье Флориды. Герои знакомятся с юными друзьями, сыном профессора Джонни и подростком-индусом Хаджи Сингхом (приемным ребенком ученого). Уроженец Калькутты обладает сверхспособностями, а Квест младший не расстается с питомцем – бульдогом Бандитом.
Отец мальчиков, Бентон Квест, близок к завершению очередного эксперимента. Доктор наук создает устройство, способное решить проблему энергетического кризиса. Злой гений Зин разрабатывает план по уничтожению мира и хочет поквитаться с давним соперником. Узнав об успешных опытах Бентона, Зин готовит контроперацию. Как обычно, преступник не собирается появляться «на сцене», а отправляет армию злых кошек.
Лазутчики берут Квеста старшего в плен – вместе с телохранителем, спецагентом Роджером «Рейсом» Бенноном. Джонни, Хаджи, Бандит, Том и Джерри отыщут похищенных и отберут ценное изобретение у злоумышленника.